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發酵

1940年，H.A.克雷伯斯提出三羧循環學說以來，檸檬酸的發酵機理逐漸被人們所認識。已經證明，糖質原料生成檸檬酸的生化過程中，由糖變成丙酮酸的過程與酒精發酵相同，亦即通過E-M途徑（二磷酸己糖途徑）進行酵解。然后丙酮酸進一步氧化脫羧生成乙酰輔酶A，乙酰輔酶A和丙酮酸羧化所生成的草酰乙酸縮合成為檸檬酸并進入三羧循環途徑。

檸檬酸是代謝過程中的中間產物。在發酵過程中，當微生物體內的烏頭酸水合酶和異檸檬酸脫氫酶活性很低、而檸檬酸合成酶活性很高時，才有利于檸檬酸的大量積累。 

乳狀液膜法

液膜分離技術在生物、重金屬工程分離中應用較多，在進行濃度比較高的廢水處理時此方法效率較高。液膜法處理廢水的第一步是把乳液和廢水放在一起，并進行攪拌，使兩者充分融合，在攪拌的過程中廢水中檸檬酸通過液膜濃縮在膜內，進而將檸檬酸分解出來。乳狀液膜法的分離過程比較簡單，并且分離效率高，對于工業應用比較實用，乳液可以重復使用，且分離效果不變。